Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNB3Q05901 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms