Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP7AQ04656 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms