Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCNT1Q02742 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms