Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms