Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BNC1Q01954 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms