Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms