Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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