Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAT1AQ00266 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms