Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VLDLRP98155 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VLDLRP98155 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms