Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NAPAP54920 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NAPAP54920 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms