Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP12AP54707 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP12AP54707 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms