Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms