Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMPHP49418 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMPHP49418 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMPHP49418 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AMPHP49418 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMPHP49418 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMPHP49418 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMPHP49418 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMPHP49418 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AMPHP49418 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms