Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ALDH9A1P49189 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms