Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5OP48047 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms