Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms