Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MDH1P40925 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MDH1P40925 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MDH1P40925 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms