Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GJA4P35212 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GJA4P35212 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJA4P35212 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms