Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCAP28676 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCAP28676 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms