Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD27P26842 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD27P26842 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD27P26842 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD27P26842 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms