Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SPRR1BP22528 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms