Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms