Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB6P18564 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms