Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRF1P14222 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRF1P14222 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRF1P14222 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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