Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOP2AP11388 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms