Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGAMP11215 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms