Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRFP10586 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRFP10586 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms