Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4BP0C0L5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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