Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRPRAP08240 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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