Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOP08100 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOP08100 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOP08100 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms