Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OTCP00480 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OTCP00480 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTCP00480 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms