Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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