Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms