Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DFNA5O60443 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DFNA5O60443 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms