Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPLO60437 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPLO60437 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPLO60437 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPLO60437 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPLO60437 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPLO60437 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPLO60437 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPLO60437 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPLO60437 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms