Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms