Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCAO15360 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCAO15360 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCAO15360 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCAO15360 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCAO15360 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCAO15360 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCAO15360 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCAO15360 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCAO15360 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms