Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETD1AO15047 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms