Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRTO14522 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRTO14522 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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