Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2F3O00716 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F3O00716 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F3O00716 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F3O00716 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms