Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
O00370 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
O00370 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
O00370 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms