Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms