Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM5B3KS81 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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