Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NOTOA8MTQ0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NOTOA8MTQ0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NOTOA8MTQ0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NOTOA8MTQ0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms