Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM149AA5PLN7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms