Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMX2A2RU54 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms