Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AFG3L2Q9Y4W6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms