Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKP3Q9Y446 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms