Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms