Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms